研究院设最高决策机构理事会，及学术委员会作为学术指导和顾问机构。

理事会的主要职能是规划研究院的发展战略、公司治理、重大决策、重要项目等事项。

学术委员会主要由国家部委、国内高校、科研机构中从事政治、经济、党建、产业、企业管理等领域的知名专家学者组成，其主要职能为负责对研究院的发展规划、年度计划、重大研究项目开展、知名研究专家聘任等提出咨询意见；对研究项目的过程管理、成果运营、研发经费的使用、研究人才的引进培养等提出指导意见；参与研究中心的重大学术活动等。